地球已經很久沒有遭受怪獸的侵害了，似乎恢復了和平。人類將目光進一步轉向宇宙，因此對抗怪獸災難的隊伍規模也在逐步縮小。而就在這時，神秘宇宙漂浮體“斯菲亞”突然向地球發動攻擊。地球與宇宙的聯系被斬斷，變成了“孤獨的行星”。